如何更好的觀察到乳腺癌

得克薩斯大學(xué)安德森分校癌癥中心的研究人員領(lǐng)導(dǎo)的一個(gè)小組克服了單細(xì)胞DNA(scDNA)測序的先前技術(shù)挑戰(zhàn)，開發(fā)了一種以單分子分辨率進(jìn)行scDNA測序的新方法。這項(xiàng)技術(shù)*揭示了三陰性乳腺癌在染色體不穩(wěn)定的最初爆發(fā)后經(jīng)歷了連續(xù)的基因拷貝數(shù)變化。

這項(xiàng)發(fā)現(xiàn)發(fā)表在《自然》雜志上，為測序數(shù)百種癌細(xì)胞提供了一種準(zhǔn)確而有效的新方法，同時(shí)也為癌癥的發(fā)展提供了新穎的見解。這些見解可以解釋為什么治療并不總是有效的，以及為什么研究人員不能在實(shí)驗(yàn)室中產(chǎn)生同質(zhì)的細(xì)胞培養(yǎng)物。

與我們?cè)趩渭?xì)胞DNA測序中的第-一種方法相比，這代表了顯著的進(jìn)步，其通量，準(zhǔn)確性和易用性大大提高。現(xiàn)在，我們能夠以前所-未有的方式解決腫瘤細(xì)胞群體內(nèi)拷貝數(shù)的微小差異。”

Nicholas Navin博士，高級(jí)作者，遺傳與生物信息學(xué)與計(jì)算生物學(xué)副教授

這項(xiàng)新技術(shù)被稱為“聲細(xì)胞標(biāo)簽化(ACT)”，首先是通過熒光激活的細(xì)胞分選從數(shù)千個(gè)細(xì)胞中分離出單個(gè)細(xì)胞核。然后通過三步化學(xué)過程將每個(gè)細(xì)胞中的DNA切割成精-確的片段，添加通用接頭并結(jié)合條形碼以進(jìn)行下一代測序。

通過這種改進(jìn)的方法，可以對(duì)有限數(shù)量的細(xì)胞中的DNA進(jìn)行測序，研究人員試圖回答有關(guān)癌癥進(jìn)化的一個(gè)常設(shè)問題。納文(Navin)的研究小組先前確定，三陰性乳腺癌會(huì)經(jīng)歷標(biāo)點(diǎn)進(jìn)化，在染色體不穩(wěn)定的初始爆發(fā)中獲得拷貝數(shù)變化，但是未知癌細(xì)胞在該事件后是否繼續(xù)積累變化。

化學(xué)過程是通過聲學(xué)液體傳輸技術(shù)執(zhí)行的，該技術(shù)使用聲波快速有效地傳輸微量液體。Navin解釋說，早期的scDNA測序方法從開始到結(jié)束需要三天的時(shí)間，而新的方法可以在三小時(shí)內(nèi)完成。